(Received: February 8, 2000; Accepted for publication: March 14, 2000; Published on Web: July 13, 2000)
分子動力学シミュレーションは、生体高分子の構造・物性・機能相関の研究に有用であることが一般に認められている。本総説では、筆者らが開発した生体分子解析用ソフトウェアPEACH(Program for Energetic Analysis of bioChemical molecules)を使って、タンパク質とDNAの分子動力学シミュレーションを行う場合の手続きを、実践的に解説する。
キーワード: Program for Energetic Analysis of bioCHemical molecules (PEACH), Molecular Dynamics (MD), Protein, DNA