ヒスチジン含有リン酸転移タンパク質変性過程の分子動力学シミュレーション

末永敦1、古明地勇人2、上林正巳3、目黒俊幸1、山登一郎*1

1 東京理科大学・基礎工学部・生物工学科, 〒278 千葉県野田市山崎2641
2 通商産業省工業技術院電子技術総合研究所, 〒305 茨城県つくば市梅園1-1-4
3 通商産業省工業技術院生命工学工業技術研究所, 〒305 茨城県つくば市東1-1-3

(Received: October 20, 1997; Accepted for publication: November 5, 1997 ; Published on Web : June 6, 1998)

 ヒスチジン含有リン酸転移タンパク質(HPr)熱変性過程の分子動力学シミュレーションを、水中で行った。温度300Kで200ピコ秒、373Kで1ナノ秒シミュレーションした結果、300Kのシミュレーションでは初期構造は安定であった。これに対し373Kでは、シミュレーションの間に2つの主な構造変化が見られた。

Keywords: HPr, Protein unfolding, Molecular dynamics, Molten globule state, Transition state


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